由于湿基质含水率可达70%～80%,如果水分得不到控制，会导致堆肥温度降低和操作无效。
通常，有机物聊的水分含量越高，就需要越大的空间以保证充分通风。粪便、污泥均属不易碎的物料，且缺少多孔结构，另外具有可塑性，物料自重也会使料堆变得更加紧实，这样孔隙体积会变得更少，使得堆肥十分困难。
对于湿基质，在设计或操作时应注意：
1，原料药进行结构调节，以获得易碎的混合无聊，如添加锯末、秸秆等；
2，进行能量调节，使得堆肥期启动快速，保证热动力平衡，包括添加能值高的无聊或添加接种剂。
另外还要考虑通畅的空气供应系统和温度控制系统，同时还要保护堆肥混合物免受风雨的侵蚀，因为水分过大堆制就很难进行。
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